应用介绍
手里一批病毒或物种的序列数据，想知道它们是什么时候分化的、传播有多快，普通的建树软件只给你一棵树，给不出时间和不确定度。BEAST X 做的是贝叶斯进化分析，用 MCMC 抽样同时估计系统发育树、分化时间和进化速率，每个结果都带可信区间。
最新的 10.5.0 版压缩包约 89 MB，所以这里填的是项目的 Releases 页面，没有转存。软件基于 Java，跨平台，随包的 BEAUti 是配套的图形界面，用来导入序列、选模型、设参数，生成 BEAST 要跑的分析文件，不用手写 XML。
贝叶斯进化分析：用 MCMC 抽样估计系统发育树、分化时间和进化速率，结果带可信区间
BEAUti 图形界面：导入序列、选替换模型和分子钟、设先验，点几下生成分析文件，不用手改 XML
分子钟模型：可以假设各分支速率相同，也可以让速率在分支间变化，更贴近真实数据
跨平台：基于 Java，Windows、macOS、Linux 都能跑，大型分析可以放到服务器上
开源免费：项目开源，代码和发布包都公开在 GitHub
最新的 10.5.0 版压缩包约 89 MB，所以这里填的是项目的 Releases 页面，没有转存。软件基于 Java，跨平台，随包的 BEAUti 是配套的图形界面，用来导入序列、选模型、设参数，生成 BEAST 要跑的分析文件，不用手写 XML。
软件功能
贝叶斯进化分析：用 MCMC 抽样估计系统发育树、分化时间和进化速率，结果带可信区间
BEAUti 图形界面：导入序列、选替换模型和分子钟、设先验，点几下生成分析文件，不用手改 XML
分子钟模型：可以假设各分支速率相同，也可以让速率在分支间变化，更贴近真实数据
跨平台：基于 Java，Windows、macOS、Linux 都能跑，大型分析可以放到服务器上
开源免费：项目开源，代码和发布包都公开在 GitHub
